Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms