Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms