Protein–RNA interactions for Protein: Q64FW2

Retsat, All-trans-retinol 13,14-reductase, mousemouse

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetsatQ64FW2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RetsatQ64FW2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms