Protein–RNA interactions for Protein: Q64704

Stx3, Syntaxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx3Q64704 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx3Q64704 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms