Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PtprdQ64487 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprdQ64487 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprdQ64487 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprdQ64487 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprdQ64487 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprdQ64487 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprdQ64487 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PtprdQ64487 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprdQ64487 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprdQ64487 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprdQ64487 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprdQ64487 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprdQ64487 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprdQ64487 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprdQ64487 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprdQ64487 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprdQ64487 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprdQ64487 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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