Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
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