Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phc1Q64028 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phc1Q64028 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms