Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms