Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sp4Q62445 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms