Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nptx1Q62443 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nptx1Q62443 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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