Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa13Q62424 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms