Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six3Q62233 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Six3Q62233 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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