Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms