Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vsx2Q61412 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms