Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PcolceQ61398 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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