Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna2Q61301 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna2Q61301 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna2Q61301 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna2Q61301 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna2Q61301 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna2Q61301 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna2Q61301 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna2Q61301 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna2Q61301 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna2Q61301 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna2Q61301 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna2Q61301 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms