Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usf1Q61069 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usf1Q61069 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usf1Q61069 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Usf1Q61069 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms