Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ift20Q61025 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms