Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grik1Q60934 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Grik1Q60934 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms