Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Slc6a4Q60857 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Slc6a4Q60857 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Slc6a4Q60857 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc6a4Q60857 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc6a4Q60857 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc6a4Q60857 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc6a4Q60857 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a4Q60857 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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