Protein–RNA interactions for Protein: Q60754

Marco, Macrophage receptor MARCO, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MarcoQ60754 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MarcoQ60754 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MarcoQ60754 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MarcoQ60754 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MarcoQ60754 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MarcoQ60754 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MarcoQ60754 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MarcoQ60754 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MarcoQ60754 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MarcoQ60754 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MarcoQ60754 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MarcoQ60754 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MarcoQ60754 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MarcoQ60754 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MarcoQ60754 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MarcoQ60754 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MarcoQ60754 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MarcoQ60754 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MarcoQ60754 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MarcoQ60754 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MarcoQ60754 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MarcoQ60754 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MarcoQ60754 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MarcoQ60754 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
MarcoQ60754 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MarcoQ60754 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MarcoQ60754 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MarcoQ60754 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MarcoQ60754 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MarcoQ60754 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MarcoQ60754 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MarcoQ60754 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms