Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SkiQ60698 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SkiQ60698 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SkiQ60698 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms