Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprnQ60673 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprnQ60673 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprnQ60673 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprnQ60673 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprnQ60673 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprnQ60673 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PtprnQ60673 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PtprnQ60673 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PtprnQ60673 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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