Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CttnQ60598 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms