Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Xrcc1Q60596 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Xrcc1Q60596 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Xrcc1Q60596 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Xrcc1Q60596 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Xrcc1Q60596 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Xrcc1Q60596 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Xrcc1Q60596 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Xrcc1Q60596 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Xrcc1Q60596 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Xrcc1Q60596 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Xrcc1Q60596 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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