Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sin3aQ60520 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3aQ60520 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms