Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sema5bQ60519 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema5bQ60519 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms