Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rabl6Q5U3K5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms