Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brip1Q5SXJ3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms