Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LpoQ5SW46 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LpoQ5SW46 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms