Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PkdccQ5RJI4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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PkdccQ5RJI4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PkdccQ5RJI4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PkdccQ5RJI4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PkdccQ5RJI4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PkdccQ5RJI4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PkdccQ5RJI4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms