Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms