Protein–RNA interactions for Protein: Q5QNQ9

Col27a1, Collagen alpha-1(XXVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,845 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col27a1Q5QNQ9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Col27a1Q5QNQ9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Col27a1Q5QNQ9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Col27a1Q5QNQ9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col27a1Q5QNQ9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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