Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps41Q5KU39 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms