Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnni3kQ5GIG6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3kQ5GIG6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms