Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ecm2Q5FW85 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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