Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkaa1Q5EG47 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prkaa1Q5EG47 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms