Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fam208bQ5DTT3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fam208bQ5DTT3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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