Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf354cQ571J5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms