Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spire1Q52KF3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spire1Q52KF3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms