Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ankrd28Q505D1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ankrd28Q505D1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ankrd28Q505D1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ankrd28Q505D1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ankrd28Q505D1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ankrd28Q505D1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ankrd28Q505D1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ankrd28Q505D1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ankrd28Q505D1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ankrd28Q505D1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ankrd28Q505D1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ankrd28Q505D1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms