Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc3lQ4KL14 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3lQ4KL14 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms