Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pacs2Q3V3Q7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Pacs2Q3V3Q7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Pacs2Q3V3Q7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms