Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2Q3V1H1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms