Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Garnl3Q3V0G7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms