Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hipk4Q3V016 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms