Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnga4Q3UW12 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnga4Q3UW12 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms