Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms