Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Znf48Q3US17 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf48Q3US17 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Znf48Q3US17 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf48Q3US17 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf48Q3US17 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Znf48Q3US17 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf48Q3US17 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf48Q3US17 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf48Q3US17 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf48Q3US17 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Znf48Q3US17 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf48Q3US17 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Znf48Q3US17 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf48Q3US17 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf48Q3US17 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf48Q3US17 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Znf48Q3US17 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf48Q3US17 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms