Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS9

Ccdc51, Coiled-coil domain-containing protein 51, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc51Q3URS9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc51Q3URS9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc51Q3URS9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms